Vargas a fost forțat să se exileze în 2018 după ce el și congregația sa au adus alimente și medicamente și s-au rugat pentru studenții care protestau împotriva regimului marxist autoritar al președintelui Daniel Ortega. Vargas s-a întors în Nicaragua în 2020 pentru a-și relua activitatea pastorală și a fost monitorizat și hărțuit în mod regulat de poliție și de alte autorități.
În cadrul unei serii de raiduri efectuate pe 17 iulie 2025, poliția națională din Nicaragua i-a reținut pe pastorul Rudy Palacios Vargas și pe alți șapte creștini fără avertisment sau mandat. Familiile celor reținuți nu au reușit să-și localizeze rudele. Un membru al familiei a raportat că aceștia au fost acuzați de trădare și „subminarea integrității naționale”.
Din 2022, guvernul nicaraguan a impus restricții din ce în ce mai severe, încercând să intimideze liderii creștini pentru a se alătura unei asociații bisericești controlate de guvern.
